Realizacja badań w ramach Zadań Celowych, w kierunku wykrywania zagrożeń zakażeniem V. cholerae, B. anthracis i Y. pestis, w miejscu służby żołnierzy. W ramach prowadzonych prac dokonywany jest monitoring zbiorników i cieków wodnych zlokalizowanych na terenach poligonowych oraz w pobliżu jednostek wojskowych w kierunku obecności V. cholerae. Prowadzony jest również monitoring epidemiologiczny przypadków zakażenia B. anthracis i Y. pestis na obszarach stacjonowania kontyngentów wojskowych.
W ramach współpracy z pracownią Bakteriologii realizowane są prace związane z depozytorium kolekcji szczepów bakteryjnych II i III grupy zagrożenia biologicznego, w tym czynników broni biologicznej. Pracownia dysponuje sprzętem i procedurami niezbędnymi do detekcji czynników III grupy zagrożenia, stale prowadzone są działania dotyczące opracowywania, weryfikacji i doskonalenia metod, procedur pomiarowych i badawczych związanych z detekcją niebezpiecznych czynników biologicznych (czynniki BMR)
W ramach współpracy z pracownią Bakteriologii realizowane są badania w zakresie patogenów alarmowych zgodnie z zaleceniami ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control - Europejskie Centrum ds. Zapobiegania i Kontroli Chorób), których celem jest monitorowanie istotnych dla zdrowia publicznego bakteryjnych patogenów alarmowych obejmujących drobnoustroje izolowane z zakażeń szpitalnych (Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa). W ramach działalności pracowni dokonywana jest analiza molekularna bakteryjnych patogenów alarmowych w celu wykrywania genów antybiotykoodporności.