Działalność naukowa Samodzielnej Pracowni Epidemiologii skupia się na trzech podstawowych kierunkach badawczych:
Epidemiologia wojskowa
analiza sytuacji epidemiologicznej i zabezpieczenia przeciwepidemicznego w Siłach Zbrojnych RP w kraju i rejonach pełnienia misji
sporządzanie opracowań i analiz z zakresu medycyny wojskowej
opracowywanie materiałów informacyjnych i szkoleniowych w dziedzinie promocji zdrowia i prewencji chorób wśród personelu wojskowego
analiza i archiwizacja wykazów czynników rakotwórczych na stanowiskach pracy i służby w Siłach Zbrojnych RP
epidemiologia chorób zakaźnych wśród personelu wojskowego
Epidemiologia żywieniowa
badanie częstotliwości spożycia żywności prowadzonej za pomocą odpowiednich kwestionariuszy
wykorzystywanie zaawansowanych metod statystycznych, jako narzędzi służących do kompleksowej analizy zachowań żywieniowych ludzi i ich stanu zdrowia w aspekcie spożycia żywności
epidemiologia chorób cywilizacyjnych: otyłość cukrzyca, nowotwory itd.
poradnictwo dietetyczne ze szczególnym uwzględnieniem personelu wojskowego
Epidemiologia genetyczna i nutrigenomika
badanie rozkładu oraz różnorodności genów w populacjach
analiza częstotliwości występowania chorób genetycznych i mutacji, które je wywołują
badanie wpływu bioaktywnych składników diety na ekspresję genów (badania na poziomie transkryptomu, proteomu, metabolomu), a także identyfikacja mechanizmów decydujących o tym, w jaki sposób żywność i żywienie wpływają na stan zdrowia