W ramach realizowanej problematyki naukowo-badawczej Zakład Ochrony Mikrofalowej współpracuje z ośrodkami naukowymi:
Wojskowym Instytutem Medycznym w Warszawie
Warszawskim Uniwersytetem Medycznym
Uniwersytetem Medycznym w Białymstoku
Uniwersytetem Medycznym w Łodzi (w zakresie diagnostyki zaburzeń sprawności układu odpornościowego spowodowanych czynnikami środowiskowymi (czynniki biologiczne i fizyczne) w badaniach in vivo, in vitro/ex vivo)
Instytutem Medycyny Pracy w Łodzi
Centralnym Instytutem Ochrony Pracy
Wojskową Inspekcją Sanitarną (w zakresie bezpieczeństwa i higieny pracy w polach elektromagnetycznych, ochrony przed promieniowaniem elektromagnetycznym, profilaktyki i ochrony zdrowia personelu zatrudnionego w zasięgu promieniowania elektromagnetycznego)